你的WesternBlot条带为什么
WesternBlot
WB条带异常解决办法
前言
WesternBlot即蛋白免疫印迹,简称为WB,是将细胞或组织总蛋白质通过电泳从凝胶转移到固相支持物NC膜(硝酸纤维素薄膜)或PVDF(聚偏二氟乙烯膜)膜上,然后用特异性抗体检测某特定抗原的技术。
我们搜集了WB中常见的异常条带,并分析失误原因,列出了解决方法,希望能对大家有所帮助。
PART01
无背景无条带(白片)
原因:最可能是一抗失效,或者二抗种属出错,比如兔(Rb)加成大鼠(Ra)。
解决办法:
1、目的蛋白完全没有信号,但同时做的内参是正常的,那么大部分情况是一抗抗体失效或者用错二抗。
2、目的蛋白完全没有信号,内参也没有信号,则考虑是否发光液失效。如果膜上没有marker则为转膜失败。
3、如果中间出现了细微的条带,可能是蛋白上样量太少,或一抗浓度过低。
PART02
高背景(均一弥漫性)
原因:封闭不够好,一抗浓度高,洗膜时间和次数不够
解决办法:高背景是WB中最常见出现的问题。如图目的条带单一清晰,但是其他地方又弥漫性较为均一的背景(比较连续的)。降低一抗浓度,增加洗膜时间和次数(5min*5次或者10min*3次)。如不能解决,可重新封闭。
PART03
出现非均一性背景
原因:膜可能曾经干过。
解决办法:转膜结束后的封闭,洗一抗,洗二抗,以及发光的时候都时刻需要注意蛋白面不要风干,风干之后结果很可能就是这个样子。注意与高背景区别。另外,夹取膜时,尽量用镊子夹取Marker所在位置,以防刮伤刮坏蛋白样。
PART04
出现黑点和黑斑
原因:封闭液未完全溶解
解决办法:封闭牛奶一定要充分溶解,如果没有完全溶解的情况下加牛奶倒膜上,会导致很多不溶性颗粒附着在膜上,这就会导致发光时候膜上的黑点。封闭结束之后PBST清洗1-3遍之后可有效解决。
PART05
非特异性条带(杂带)
原因:一抗非特异性与蛋白结合,多克隆抗体易发生。
解决办法:更换一抗或降低一抗浓度。此种情况绝大多数是因为一抗特异性太差,或者是一抗浓度太高引起的非特异性结合。如果无法判断哪一条是目的条带,又实在没有更好的抗体,建议增加阴性对照和阳性对照来确定上述哪个条带是目的条带。
PART06
条带有边缘规则的白圈
原因:电转中膜和胶之间存在气泡。
解决办法:转膜前去掉膜和胶之间的气泡。转模时把电泳胶用纯水清洗下,将电泳胶平铺到滤纸上,仔细检查滤纸与胶之间是否有气泡。然后再往胶上面浇点电转液,用两只手的拇指和食指轻轻夹住PVDF膜的两侧中间,使膜成U型,然后将U型的底部接触胶的中间,慢慢往两边放下膜,这样一般气泡很少。放上滤纸后,用滚轮稍微贴实下,然后盖上海绵。注意滚气泡时不要来回赶,这样反而会带入气泡。
PART07
条带中有白色(反白)
原因:中心部位高浓度酶把底物消耗过快,中间部位底物消耗结束之后就不发光了。
解决办法:快速曝光,在中间部位底物消耗之前拍照成功。如果不行,建议降低蛋白量,降低一抗二抗浓度。
PART08
条带拖尾
原因:蛋白量太大或轻微降解,一抗浓度过高或时间太长。
解决办法:根据情况调整蛋白量,同时一抗浓度和时间也可以降低。一般来说,蛋白量都是经过测试和预实验摸索得出的最适蛋白量,因此不太可能是蛋白量过多引起的。最有可能的是因为一抗浓度太高,作用时间太长引起的。如果经重复确定是蛋白降解,那么需要重新提取蛋白。
PART09
某个条带变形
原因:SDS-PAGE胶中存在气泡或者某不溶性颗粒
解决办法:配胶过程中要小心,使用无杂质的液体。配胶用的海绵垫,如果用了很多年之后,会从下面往上面漏小气泡,当气泡足够小并且胶快凝固的时候,走到中间的小气泡就停留在胶内,并会影响到后面的跑胶。另外配胶用的水,SDS,Tris缓冲液均要注意不要有杂质。
PART10
条带呈哑铃状
原因:配置胶凝固不均一。
解决办法:出现哑铃最大的可能是胶没有配置好,胶凝固后不均一。如果如图中示意拔完梳子之后梳孔不平整,那么条带多半会出现哑铃状。另外还有一种可能是样品中含有太多杂质,没有完全离心下来,然后杂质沉积在孔的中间,蛋白自然被推挤到两边。可以离心后上样。
PART11
最边缘条带弯曲
原因:电泳电流不均一。
解决办法:换用新的电泳槽;或尽量不使用两边的两孔,两端加1*Loading压样。上样最好在胶的中间,中间电场最均一。
PART12
其他问题
(1)整个条带呈“︶”状:凝胶冷却不均一,电泳槽老化。
(2)整个条带呈“︵”状:凝胶冷却不均一。
(3)电泳时溴酚蓝拖尾:样品混合不均一。
(4)溴酚蓝很粗:浓缩胶浓缩效果不好,可能是浓缩胶太短。
(5)有纵向纹理:上样样品中存在不溶性颗粒
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总结
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如果是条带“形状”的问题,主要集中在“样品制备”和“配胶、电泳”环节,与“转膜”和“免疫检测”基本没有任何关系。
“样本制备”的问题,主要集中在样本可能出现降解,样本没有完全溶解,加样不合适等;
“配胶和电泳”主要集中试剂可能过期,没有正确保存,成胶时间过快,胶没有完全凝好,电泳液时间过长,电流或电压不合适等;
END
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